不同粒径颗粒物在高浑浊河口生物地球化学过程中的作用研究(2010－2012，国家自然科学基金面上项目，40976044，总经费52万，主持人：于志刚教授)
长江口及邻近海域底边界层生物地球化学过程研究(2010-2013，国家自然科学基金重大国际(地区)合作研究项目，40920164004，总经费150万，主持人：于志刚教授)
海洋环境变化与水母暴发的相互作用（2011-2015，国家基础研究重大项目（973）中国近海水母暴发的关键过程、机理及生态环境效应第二课题，2011CB403602，330万，主持人：于志刚教授）
不同来源有机碳在长江口-东海内陆架的水动力分选研究（国家自然科学基金面上项目，2012-2015，41176063，总经费72万，主持人：姚鹏副教授）
扇贝对虾加工关键技术与设备研发及扇贝养殖生态环境保障技术的应用与示范（2012-2016，国家海洋局公益性行业科研专项经费项目，201205031，总经费1400万/海大201万，承担经费90万元，参加人：甄毓、姚鹏）
赤潮浮游生物综合测量系统及分析技术（2001.12-2004.12，国家高技术研究发展计划（863）项目，2001AA635090，220万，主持人：于志刚教授）
海水中溶解有机氮、磷自动消化技术的研究（2002.10-2004.10，国家高技术研究发展计划（863）项目，2002AA639450， 20万，主持人：陈洪涛副教授） ）
沿海地下卤水的铀系地球化学研究（2003-2005，国家自然科学基金面上项目40276026，33万，主持人：于志刚教授）
高浑浊河口水域的生物地球化学过程（2002-2008，国家基础研究重大项目（973）中国典型河口-近海陆海相互作用及其环境效应第五课题，220万，2002CB412405，子课题主持人：于志刚教授） ）
基于生物标志化合物的海洋浮游藻类快速分类方法研究（2004-2006，高等学校博士学科点专项科研基金，20030423005，6万，主持人：于志刚教授） ）
水文生物地球化学过程及其对生态系统结构的影响（2004-2009.03，国家自然科学基金重大项目“大型水利工程对长江流域重要生物资源的长期生态学效应”第二课题，30490232，140万，子课题主持人：于志刚教授） ）
海洋浮游藻化学分类方法研究（2005.01-2005.12，国家自然科学基金面上项目，40476044，10万，主持人：于志刚教授） ）
北黄海区块水体环境调查与研究（2006.01-2009.12，我国近海海洋综合调查与评价专项（908项目），908-01-ST02，100万，项目组副组长：于志刚教授） ）
重大海洋赤潮灾害实时监测与预警系统--赤潮藻类快速抗体检测技术, 2007AA092001-11,2010-2012,科技部863科技创新计划，子课题负责人：米铁柱副教授
应用分子生物学技术估算赤潮藻现场生长率的方法研究，项目批准号：40406028， 国家自然科学基金面上项目青年基金，2005－2007，主持人：米铁柱副教授
基于胶体金免疫层析技术的赤潮藻现场检测方法研究，2004－2005，科技部863科技创新计划，2004AA639780，20万，主持人：米铁柱副教授
近海重金属污染新型监测与风险评估技术业务化示范应用，公益性行业科研专项子课题，2011-2014, 52万，201105015，主持人：陈洪涛副教授
水沙剧烈变化条件下黄河口湿地重金属的生物地球化学过程研究，山东省自然科学基金项目，2008－2011，5万，Y2008E06，主持人：陈洪涛副教授
镭同位素示踪风暴潮对莱州湾南岸地下卤水影响的研究（ZR2011DM010），山东省自然科学基金，2011.07-2014.07，主持人：江雪艳博士
流域水环境生态学基准阈值与方法学，国家水体污染控制与治理科技重大专项（水专项）子课题，2008ZX07526-003-03，2008-2010，110万元，主持人：姚庆祯副教授
黄河口湿地生源要素与重金属的生物地球化学过程及其对黄河水沙变化的响应， 国家自然科学基金，40876038，2009-2011，48万元，主持人：姚庆祯副教授
不同粒径颗粒物对黄河向渤海输送生源要素的贡献研究，山东省自然科学基金，ZR2010DM003，2011-2013，，7万元，主持人：姚庆祯副教授
赤潮藻类电致化学发光分子探针检测技术研究，国家自然科学基金面上项目青年科学基金项目，2008～2010，40706044，课题负责人：甄毓副教授
海洋浮游藻特征色素高分辨高效液相色谱分析方法研究（2009-2011，国家自然科学基金人才项目青年科学基金，40806029，总经费20万，主持人：姚鹏副教授
